蘭嶼低放貯存場位於蘭嶼島東南端的龍門地區，三面環山一面向海，有自然屏障且5公里內無人居住，場內共設置23座貯存壕溝，用於貯存來自全國各界的低放射性廢棄物。

貯存場採多重障壁設計，即廢料先以水泥固化為硬塊(第1道障壁)，再以鋼桶盛裝(第2道障壁)，運抵貯存場後貯存於混凝土壕溝內(第3道障壁)，貯存場混凝土壕溝內具有入滲水收集系統（第4道障壁），入滲水收集後再以蒸發器處理至其放射性活度小於儀器最小可測量後於場內回收使用（第5道障壁）。

蘭嶼低放貯存場位居蘭嶼島東南方海岸線旁，逐坡而建，貯存場內各項結構之耐震設計，均依據「建築技術規則構造篇」有關耐震設計相關條款之規定辦理。 本公司於108年為進行蘭嶼低放貯存場十年再評估報告，重新檢核各貯存溝耐震設計，該報告顯示設計地表水平加速度達0.45g，貯存溝等設施相當於可承受「交通部中央氣象局地震震度分級表」七級震度以上之地震。 另，東側沿海區域築有護岸約1300公尺，採用「混凝土及漿砌卵石混合重力式複合斷面」設計，堤頂寬度達1公尺，高度為海拔12.5公尺，而貯存溝位置之高程分別為11、14、16、22及28公尺，可防止海嘯之侵襲。 蘭嶼低放貯存場經海嘯模擬分析結果，海嘯造成的海水溢淹高程最高達5.96公尺，低於結構物所在基地高程(高程11公尺) ，對蘭嶼低放貯存場無安全影響。