綠島電業民國60年前由鄉公所經營，由於柴油發電成本昂貴(每度電平均5元)，居民需負擔之電費較高於本公司標準電費4至6倍，為響應政府改善離島人民生活，本公司於民國61年開始策劃辦理離島供電，該鄉南寮、中寮、公館於民國62年才全部有配電線路，綠島電業為滿足用戶需求，將發電設備原30KW更新為60KW柴油發電機組2部，每日供電時數由3小時增加為6小時(18~24時)。民國63年起依照行政院核准「台電公司接辦台灣離島電業實施方案」，本公司不計盈虧，以謀加強偏遠地區民眾服務，於民國64年正式接辦綠島電業工作，接辦後用電費用改按台電統一收費。

民國69年將綠島發電廠由原飛機場附近遷至南寮村現址，並將鄉公所移交之60KW發電機組二部分別於69年、70年汰換為500KW柴油發電機組四部，初期每日發電11小時，於70年10月20日延長為13至16小時，至72年2月1日配合地方發展改為全日24小時供電。

綠島地區近年來因觀光產業蓬勃發展，用電負載急遽增加，致原柴油發電機組500KW四部，已無法滿足地區用電需求，於民國87年間再增設機組1,000KW三部，及91年擴建1,500KW柴油發電機組二部，同時辦理全島配電設備改善工作，將原3.3KV配電線路改壓為11.4KV及部分架空線路改為地下化，大幅提升供電品質及可靠度。

民國98年11月將原500KW二部更新為2,000KW二部，現有總裝置容量11,000KW，將可滿足民生用電需求，而用電戶數至民國104年12月底為1,216戶(63年用電戶439戶)。