針對新北市環保局指稱台電林口電廠應適用美國MATS新設排放標準 (Mercury and Air Toxics Standards ,美國汞暨有毒氣體排放標準)，而非比較寬鬆的既設標準，台電回應，新北市環保局誤解了，林口電廠於二○一一年動工開始興建，已採用最新可行技術，林口電廠汞排放遠低於美國當時的標準;後來美國於二○一三年訂出更嚴格的新設標準，台電亦努力讓林口電廠符合美國新設標準。台電承諾，未來的深澳也將秉持一貫的態度，採購最先進機組與防制設備，為台灣打造世界第一流低污染的電廠，滿足北部民眾及企業投資的用電需求，除可符合國內排放標準外，一定可符合美國MATS新設排放標準，請民眾放心。

有關新北市環保局指出，台電林口電廠重金屬汞測值超過美國MATS新設排放標準，台電解釋，該筆較高資料為二○一七年五月二十六日之排放數值，當時一號機進行不同煤質燃燒的環保測試所致。台電強調，去(二○一七)年七月到八月間，台電提供給新北市府的汞排放汞排放共有四筆資料，其中的三筆，皆符合美國新設標準，唯一不符合的那筆是測試資料，不能以偏概全。台電進一步說明，林口電廠平常時運轉使用的燃煤，均會進行最佳調配，台電會讓林口電廠符合美國新設燃煤電廠標準。